09 日志型存储:为什么选择它作为底层存储? 在上一讲中,我们学习了存储引擎的逻辑概念与架构。这些概念和架构都是总结了数个存储引擎的特点后,勾勒出的高度抽象的形象。目的是帮助你对数据库存储引擎,特别是分布式数据库存储引擎有一个总体认识,从而建立起一个知识体系。

但是,只有高度抽象的内容,而没有具体的案例,对于理解相关概念是远远不够的。这一讲,我将以经典日志合并树(LSM 树)——这个典型的日志型存储引擎为切入点,为你直观展示存储引擎的设计特点;同时我会解释为什么此类存储引擎特别适合于分布式数据库。

那么,我们首先开始介绍 LSM 树的结构特点。

LSM 树的结构

LSM 树存储引擎的结构暗含在它的名字内。LS 代表日志结构,说明它是以日志形式来存储数据的,那么日志有什么特点呢?如果你对财务记账有些了解的话,会知道会计在删除一笔记录时,是不会直接拿着橡皮擦去擦掉这个记录的,而是会写一笔与原金额相等的冲抵操作。这就是典型的日志型存储的模式。

日志型存储的特点是对写入非常友好,不像 B 树等结构需要进行随机写,日志存储可以进行顺序性写。因为我们常用的 HDD 磁盘是有旋转机构的,写入延迟主要发生在磁盘旋转与读写臂的移动上。如果数据可以顺序写入,可以大大加快这种磁盘机构的写入速度。

而 M 则暗含这个结构会存在合并操作,形成最终的可读取结构。这样读取操作就不用去查找对于该记录的所有更改了,从而加快了读取速度。同时将多个记录合并为一个最终结果,也节省了存储空间。虽然合并操作有诸多优点,但是它也不是没有代价的,那就是会消耗一定的计算量和存储空间。

现在让我们开始详细介绍 LSM 树的结构。

LSM 树包含内存驻留单元和磁盘驻留单元。首先数据会写入内存的一个缓冲中,而后再写到磁盘上的不可变文件中。

内存驻留单元一般被称为 MemTable(内存表),是一个可变结构。它被作为一个数据暂存的缓冲使用,同时对外提供读取服务。当其中的数据量到达一个阈值后,数据会被批量写入磁盘中的不可变文件内。

我们看到,它最主要的作用是将写入磁盘的数据进行排序,同时批量写入数据可以提高写入的效率。但是数据库一旦崩溃,内存中的数据会消失,这个时候就需要引入“07 概要:什么是存储引擎,为什么需要了解它”中提到的提交日志来进行日志回放,从而恢复内存中的数据了。但前提是,数据写入内存之前,要首先被记录在提交日志中。

磁盘驻留单元,也就是数据文件,是在内存缓冲刷盘时生成的。且这些数据文件是不可变的,只能提供读取服务。而相对的,内存表同时提供读写两个服务

关于 LSM 树的结构,一般有双树结构和多树结构两种。前者一般是一个理论说明,目前没有一个实际的存储引擎是使用这种结构的。所以我简单说一下双树概念,它有助于你去理解多树结构。

双树中的两棵树分别指:内存驻留单元和磁盘驻留单元中分别有一棵树,你可以想象它们都是 B 树结构的。刷盘的时候,内存数据与磁盘上部分数据进行合并,而后写到磁盘这棵大树中的某个节点下面。成功后,合并前的内存数据与磁盘数据会被移除。

可以看到双树操作是比较简单明了的,而且可以作为一种 B 树类的索引结构而存在。但实际上几乎没有存储引擎去使用它,主要原因是它的合并操作是同步的,也就是刷盘的时候要同步进行合并。而刷盘本身是个相对频繁的操作,这样会造成写放大,也就是会影响写入效率且会占用非常大的磁盘空间。

多树结构是在双树的基础上提出的,内存数据刷盘时不进行合并操作,而是完全把内存数据写入到单独的文件中。那这个时候另外的问题就出现了:随着刷盘的持续进行,磁盘上的文件会快速增加。这时,读取操作就需要在很多文件中去寻找记录,这样读取数据的效率会直线下降。

为了解决这个问题,此种结构会引入合并操作(Compaction)。该操作是异步执行的,它从这众多文件中选择一部分出来,读取里面的内容而后进行合并,最后写入一个新文件中,而后老文件就被删除掉了。如下图所示,这就是典型的多树结构合并操作。而这种结构也是本讲介绍的主要结构。

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最后,我再为你详细介绍一下刷盘的流程。

首先定义几种角色,如下表所示。

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数据首先写入当前内存表,当数据量到达阈值后,当前数据表把自身状态转换为刷盘中,并停止接受写入请求。此时会新建另一个内存表来接受写请求。刷盘完成后,由于数据在磁盘上,除了废弃内存表的数据外,还对提交日志进行截取操作。而后将新数据表设置为可以读取状态。

在合并操作开始时,将被合并的表设置为合并中状态,此时它们还可以接受读取操作。完成合并后,原表作废,新表开始启用提供读取服务。

以上就是经典的 LSM 树的结构和一些操作细节。下面我们开始介绍如何对其进行查询、更新和删除等操作。

查询、更新与删除操作

查询操作本身并没有 LSM 树的特色操作。由于目标数据可能在内存表或多个数据表中,故需要对多个数据源的结果数据进行归并操作。其中使用了排序归并操作,原因也非常简单,因为不论是内存表还是数据表,其中的数据都已经完成了排序。排序归并算法广泛应用在多种数据库中,如 Oracle、MySQL,等等。另外数据库中间 Apache ShardingShpere 在处理多数据源 order by 时,也使用了这个方法。感兴趣的话你可以自行研究,这里我就不占用过多篇幅了。

而查询另外一个问题是处理同一份数据不同版本的情况,虽然合并操作可以解决部分问题,但合并前的数据还需要通过查询机制来解决。我刚介绍过 LSM 树中对数据的修改和删除本质上都是增加一条记录,因此数据表和内存表中,一份数据会有多条记录,这个时候查询就需要进行冲突处理。一般一份数据的概念是它们具有相同的 key,而往往不同的版本会有时间戳,根据这个时间戳可以建立写入顺序,这类似于向量时钟的概念。故查询中我们很容易判断哪条数据是最新数据。

更新和删除操作本质上是插入数据,然后根据上面提到的冲突处理机制和合并操作来获取最终数据。更新操作是比较简明的,插入新数据就好了。但是删除操作时插入的是什么呢?

一般插入的是特殊的值,被称作墓碑(Tombstone)。它是一个特殊的值,用来表示记录被删除。如果要产出一个范围内数据呢?Apache Cassandra 的处理方法是引入范围墓碑(Range Tombstone)。

比如有从 k0 到 k9 的 9 条数据,在 k3 处设置开始删除点(包含 k3),在 k7 处设置结束删除点(不包含 k7),那么 k3 到 k6 这四条数据就被删除了。此时查询就会查不到 k4 到 k6,即使它们上面没有设置墓碑。

以上我们介绍了 LSM 树中最基本的操作,下面我再为你介绍一种非常特殊的操作,那就是合并操作。

合并操作

合并操作是用来维护 LSM 树的结构的,以保证其可以正常运行。需要强调的一点是,我们这里说的合并操作针对的是 LSM 树的结构里面提到的多树结构。在多树结构中,磁盘中表的数量随着刷盘动作的持续进行,而变得越来越多。合并操作正是让它们减少的一种手段。

合并操作会根据一定规则,从磁盘的数据文件中选择若干文件进行合并,而后将新文件写入磁盘,成功后会删除老数据。在整个操作的过程中,对内存的消耗是完全可控的。这是由于每个数据文件都是经过排序的,如上一讲提到的查询规则一样,我们依然可以通过排序归并来合并多个文件中的数据。这种合并每次只会加载部分数据,也就是每个文件头部的数据,进入内存进行合并操作。从而很好地控制了合并操作对内存资源的消耗。

在整个合并的过程中,老的数据表依然可以对外提供读取服务,这说明老数据依然在磁盘中。这就要求磁盘要留有一定的额外空间来容纳生成中的新数据表。同时合并操作可以并行执行,但是一般情况下它们操作的数据不会重合,以免引发竞争问题。合并操作既可以将多个数据文件合并成一个,也可以将一个数据文件拆分成多个。

常见的合并策略有 Size-Tiered Compaction 和 Leveled Compaction。

Size-Tiered Compaction

下图就是这种策略的合并过程。

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其中,数据表按照大小进行合并,较小的数据表逐步合并为较大的数据表。第一层保存的是系统内最小的数据表,它们是刚刚从内存表中刷新出来的。合并过程就是将低层较小的数据表合并为高层较大的数据表的过程。Apache Cassandra 使用过这种合并策略。

该策略的优点是比较简单,容易实现。但是它的空间放大性很差,合并时层级越高该问题越严重。比如有两个 5GB 的文件需要合并,那么磁盘至少要保留 10GB 的空间来完成这次操作,可想而知此种容量压力是巨大的,必然会造成系统不稳定。

那么有没有什么策略能缓解空间放大呢?答案就是 Leveled Compaction。

Leveled Compaction

如名称所示,该策略是将数据表进行分层,按照编号排成 L0 到 Ln 这样的多层结构。L0 层是从内存表刷盘产生的数据表,该层数据表中间的 key 是可以相交的;L1 层及以上的数据,将 Size-Tiered Compaction 中原本的大数据表拆开,成为多个 key 互不相交的小数据表,每层都有一个最大数据量阈值,当到达该值时,就出发合并操作。每层的阈值是按照指数排布的,例如 RocksDB 文档中介绍了一种排布:L1 是 300MB、L2 是 3GB、L3 是 30GB、L4 为 300GB。

该策略如下图所示。

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上图概要性地展示了从 L1 层开始,每个小数据表的容量都是相同的,且数据量阈值是按 10 倍增长。即 L1 最多可以有 10 个数据表,L2 最多可以有 100 个,以此类推。

随着数据表不断写入,L1 的数据量会超过阈值。这时就会选择 L1 中的至少一个数据表,将其数据合并到 L2 层与其 key 有交集的那些文件中,并从 L1 中删除这些数据。

仍然以上图为例,一个 L1 层数据表的 key 区间大致能够对应到 10 个 L2 层的数据表,所以一次合并会影响 11 个文件。该次合并完成后,L2 的数据量又有可能超过阈值,进而触发 L2 到 L3 的合并,如此往复。

可见,Leveled Compaction 与 Size-Tiered Compaction 相比,每次合并时不必再选取一层内所有的数据,并且每层中数据表的 key 区间都是不相交的,重复 key 减少了,所以很大程度上缓解了空间放大的问题。

当然在实际应用中会组合两种策略,比如经典的 RocksDB 会在 L0 合并到 L1 时,使用 Size-Tiered Compaction;而从 L1 开始,则是采用经典的 Leveled Compaction。这其中原因是 L0 的数据表之间肯定会存在相同的 key。

以上介绍了 LSM 树中经典的合并问题,那么在合并过程中常常面临各种困境,比如上文提到的空间放大问题。下面我为你介绍 RUM 假说,来详细分析此类问题。

RUM 假说

开始介绍这个假说之前,你要先明确几个“放大”概念。

  • 读放大。它来源于在读取时需要在多个文件中获取数据并解决数据冲突问题,如查询操作中所示的,读取的目标越多,对读取操作的影响越大,而合并操作可以有效缓解读放大问题。
  • 写放大。对于 LSM 树来说,写放大来源于持续的合并操作,特别是 Leveled Compaction,可以造成多层连续进行合并操作,这样会让写放大问题呈几何倍增长。
  • 空间放大。这是我在说合并的时候提到过的概念,是指相同 key 的数据被放置了多份,这是在合并操作中所产生的。尤其是 Size-Tiered Compaction 会有严重的空间放大问题。

那么我们可以同时解决以上三种问题吗?根据 RUM 的假说,答案是不能。

该假说总结了数据库系统优化的三个关键参数:读取开销(Read)、更新开销(Update)和内存开销(Memory),也就是 RUM。对应到上面三种放大,可以理解为 R 对应读放大、U 对应写放大,而 M 对应空间放大(Memory 可以理解为广义的存储,而不仅仅指代内存)。

该假说表明,为了优化上述两项的开销必然带来第三项开销的上涨,可谓鱼与熊掌不可兼得。而 LSM 树是用牺牲读取性能来尽可能换取写入性能和空间利用率,上面我已经详细阐明其写入高效的原理,此处不做过多说明。

而有的同学会发现,合并操作会带来空间放大的问题,理论上应该会浪费空间。但是 LSM 树由于其不可变性,可以引入块压缩,来优化空间占用使用,且内存不需要做预留(B 树需要额外预留内存来进行树更新操作),从而使其可以很好地优化空间。

你应该知道,RUM 所描述的内容过于简单,一些重要指标如延迟、维护性等没有涵盖其中,但是它可以作为我们工具箱里面的一个短小精干的扳手,来快速分析和掌握一个存储引擎的特点。

总结

至此,我们学习了一个典型的面向分布式数据库所使用的存储引擎。从其特点可以看到,它高速写入的特性对分布式数据库而言是有非常大吸引力的,同时其KV 结构更是分片所喜欢的一种数据格式,非常适合基于此构建分布式数据库。所以诸如 Apache Cassandra、ClickHouse 和 TiDB 等分布式数据库都选用 LSM 树或类似结构的存储引擎来构建分布式数据库。

参考资料

https://learn.lianglianglee.com/%e4%b8%93%e6%a0%8f/24%e8%ae%b2%e5%90%83%e9%80%8f%e5%88%86%e5%b8%83%e5%bc%8f%e6%95%b0%e6%8d%ae%e5%ba%93-%e5%ae%8c/09%20%20%e6%97%a5%e5%bf%97%e5%9e%8b%e5%ad%98%e5%82%a8%ef%bc%9a%e4%b8%ba%e4%bb%80%e4%b9%88%e9%80%89%e6%8b%a9%e5%ae%83%e4%bd%9c%e4%b8%ba%e5%ba%95%e5%b1%82%e5%ad%98%e5%82%a8%ef%bc%9f.md